Sistemática Filogenética
Un curso práctico para estudiantes de ciencias biológicas para aprenderlos principios y programas básicos de la Sistemática Filogenética.
Curso en construcción
Resumen y propósitos del curso
Los análisis filogenéticos se han convertido en una metodología estándar para los estudios comparativos en cualquier campo de la biología. Este curso pretende enseñar los fundamentos de los análisis filogenéticos y aprender el uso de los diferentes programas de cómputo, con especial énfasis en los problemas inherentes a su aplicación a través de las herramientas brindadas por la sistemática, la biogeografía y la evolución.
Conceptos fundamentales
Este curso incluye un primer encuentro con los siguientes temas entremezclados a lo largo del curso: La comparación entre distintos métodos de clasificación. Clasificaciones naturales. Homología, caracteres y estados de carácter. Los árboles filogenéticos, como leerlos y criterios de optimización. Criterios básicos como sinapomorfías, plesiomorfías, homoplasia, Grupos monofiléticos, parafiléticos y polifiléticos. Enraizamiento y búsqueda de árboles filogenéticos. Algoritmos exactos y heurísticos (Algoritmos de distancias. Máxima verosimilitud, inferencia bayesiana y aproximación a coalescencia). El tratamiento de datos en filogenias moleculares, morfología y comportamieno. Medidas de ajuste y pesado de caracteres y los problemas que pueden causar. Medidas de soporte. Tratamiento de partición de datos. Caracteres y concepto de homología. Alineamientos. Modelos de evolución molecular. Análisis filogenómico. Reloj molecular. Coevolución, biogeografía histórica. Métodos comparativos filogenético. Filogeografía, y análisis genético-poblacionales.
Resultados de aprendizaje esperados
Después del curso el estudiante debe ser capaz de:
- Construir hipótesis filogenéticas y su análisis en un contexto biológico.
- Describir los métodos y principios fundamentales de la sistemática filogenética.
- Aproximarse de manera crítica a los diferentes métodos de inferencia filogenética (métodos de distancia, parsimonia, Maximum Likelihood, inferencia bayesiana, reticulaciones e hibridación)
- Relacionar los diferentes tipos de análisis con los posibles patrones evolutivos que se pueden inferir o correlacionar para ser aplicados a grupos de interés.
- Desarrollar las capacidades para implementar análisis en los principales paquetes y su posterior análisis.